Okulumuz Üsküdar Çengelköy’ ün Şirin bir mahallesi olan Kuleli mahallesinde, 1972 yılında dönemin İstanbul Valisi Vefa POYRAZ’ın girişimi ve vatandaşların işbirliği ile prefabrik olarak yapılmıştır. Okula o zamanki mahallenin ismi olan EMEK İlkokulu adı verilmiştir. 23.09.1998 tarihinde hayırsever Mesadet DOĞUER İstanbul il Milli Eğitim ile yaptığı protokolle, Milli Eğitime 10 milyon bağış yaparak, 24 yaşında vefat eden oğlu Taylan’ın adının verilmesini istemiştir. Okulun ismi bu tarihten itibaren Taylan Doğuer İlkokulu olmuĢtur. 2004 yılında ise hayırsever Sabri ALBEYĠT ve Dr. Celal ZEHEBİ okula ek olarak 2 yeni sınıf yapmışlardır. Okul Kuleli mahallesine 35 yıl ilköğretim okulu olarak hizmet etmiştir.
2007 yılında öğrenci sayısının azlığından dolayı, gerekli incelemeler yapılarak T.C Milli Eğitim Bakanlığı’nın Özel Eğitim Rehberlik ve Danışma Genel Müdürlüğü’nün onayı ile Otistik Çocuklar Eğitim Merkezine dönüştürülmüştür.
İlköğretim olarak inşa edilen okul binasının otistik çocukların eğitimine uygun olmamasından dolayı, ana bina 2009-2010 eğitim-öğretim yılının ara tatilinde yıkılmıştır. Üsküdar Belediyesi ve TOGEM’in katkılarıyla Kalyon İnşaat’a okul yeniden yaptırılmıştır. Yeni bina 08.03.2009 tarihinde eğitim öğretime başlamıştır. Yeni binada 7 sınıf, 1 müdür odası, 1 müdür yardımcısı odası, 3 öğrenci tuvaleti, 2 öğretmenler tuvaleti bulunmaktadır.
2014-2015 Öğretim yılı içerisinde Kalyon İnşaat tarafından; 1 yemekhane, 1 Mutfak, 1 Çok Amaçlı Salon, 1 Kondisyon Odası, 2 Sınıf, 1 Depo, 1 Atölye ve 1 Öğrenci tuvaleti daha yaptırılmıştır.
23 Ocak 2015 itibariyle okulumuzun adı, Sakine Kalyoncu Özel Eğitim Uygulama Merkezi olarak değiştirilmiştir.
Şu an okulda 39 öğrenci, 1 müdür, 1 müdür yardımcısı, 5 özel eğitim sınıf öğretmeni, 5 branş öğretmeni ve 10 ücretli öğretmen ile eğitim-öğretimine devam etmektedir.